ANÁLISE DE ABUNDÂNCIA BACTERIANA NO ESTUDO DA ECOLOGIA MICROBIANA DE SEDIMENTOS MARINHOS

Resumo

Os ecossistemas de mar profundo representam cerca de 65% da superfície do planeta e desempenham um papel importante na produção de biomassa e nos ciclos biogeoquímicos em uma escala global. Estes processos são amplamente mediados por procariotos bentônicos, os quais utilizam detritos orgânicos para a produção de biomassa e respiração. Por este motivo, os sedimentos marinhos se configuram como importante matriz biológica e tem grande relevância na ecologia do sistema de mar profundo. No tempo geológico, eventos que ocorrem neste compartimento, como a degradação de matéria orgânica, afetam profundamente a composição química do oceano e da atmosfera. Devido à sua importância e complexidade, o sistema de mar profundo e a sua microbiota associada têm sido objeto de inúmeros estudos ao longo dos últimos 50 anos, especialmente na última década. Os parâmetros mais comumente analisados nos sedimentos são abundância bacteriana, biomassa e atividade metabólica. Diversas metodologias podem ser utilizadas na análise da atividade microbiana em sedimentos, entre elas a incorporação de aminoácidos marcados com ¹⁴C ou ³H e a medida da respiração bacteriana. A análise de biomassa frequentemente exige a determinação prévia da abundância bacteriana, tornando imprescindível que a quantificação da microbiota do sedimento seja realizada de forma correta. A separação das células das partículas de sedimento e sua apropriada desagregação são necessárias para aplicações de microscopia de epifluorescência e para a análise por citometria em fluxo. O uso otimizado das técnicas de extração e análise e sua avaliação de modo combinado com outros parâmetros microbianos possibilitará um maior entendimento do papel desenvolvido pelos organismos procariotos nos oceanos do mundo.